藤原效應（英語：Fujiwhara effect），是指兩個距離不遠的水旋渦或大氣旋渦（例如熱帶氣旋），因為渦度、質量及相對位置的不同，而互相影響的狀態。藤原效應最早是由當時的日本中央氣象台（今日本氣象廳）台長、日本氣象學家藤原咲平在1921至31年間所進行的一系列水工實驗及研究發表，主要解釋當兩個颱風同時形成並互相靠近時所產生的交互作用，因而得名。藤原咲平發現，兩個接近的水旋渦，它們的運動軌跡會以兩者連線的中心為圓心，繞著圓心互相旋轉。而大氣旋渦亦出現類似情況。
熱帶氣旋之間的藤原效應俗稱「雙颱效應」，熱帶氣旋通常會隨著副熱帶高壓和低壓槽的轉變而移動。由於颱風本身以氣旋式（北半球為逆時針向，南半球為順時針向）旋轉，颱風以外周圍的氣流亦受其影響，為氣旋式風場（風場又稱駛流場）。若有一質點位於氣旋式風場中，必會為風場帶動，移動路徑將為氣旋式旋轉。兩個颱風即因受到彼此風場影響，會呈氣旋式互繞。實際大氣的大尺度背景風場，遠比單純雙颱風交互作用時複雜，再加上水潛熱釋放以及地球旋轉的寇里奧利力（科氏力）隨緯度增加，因此兩個颱風除了互繞外，還可能產生合併、分離、拉伸等現象。
藤原效應的發生有距離的限制：兩個距離太遠的氣旋是不會發生藤原效應的。一般來說，兩個颱風通常慢慢靠近，直到相距約1000至1200公里（亦有說1000至1500公里之間的其他數值）時，開始受彼此影響，呈氣旋式螺旋軌跡接近，開始產生藤原效應。但到800公里左右時，有兩種情形可能發生：合併或者分離。又過程中亦可能隨颱風登陸而造成強度的減弱、消散，改變了兩個颱風的交互作用。
雙颱風產生反時鐘方向相互旋轉之藤原效應雲系圖
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